MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus CNRZ32

Total Repeats: 48539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021744	TA	3	6	72	77	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021744	AAT	2	6	80	85	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021744	TTG	2	6	93	98	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021744	ATT	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021744	TA	3	6	135	140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021744	G	8	8	172	179	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021744	T	6	6	288	293	0 %	100 %	0 %	0 %	525706522
8	NC_021744	AC	3	6	305	310	50 %	0 %	0 %	50 %	525706522
9	NC_021744	A	7	7	357	363	100 %	0 %	0 %	0 %	525706522
10	NC_021744	TCTT	2	8	364	371	0 %	75 %	0 %	25 %	525706522
11	NC_021744	AAAT	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	525706522
12	NC_021744	A	6	6	504	509	100 %	0 %	0 %	0 %	525706522
13	NC_021744	AAAT	2	8	586	593	75 %	25 %	0 %	0 %	525706522
14	NC_021744	TGC	2	6	604	609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706522
15	NC_021744	ATT	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706522
16	NC_021744	TGG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706522
17	NC_021744	AGT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706522
18	NC_021744	TA	3	6	746	751	50 %	50 %	0 %	0 %	525706522
19	NC_021744	TTA	2	6	777	782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706522
20	NC_021744	A	6	6	790	795	100 %	0 %	0 %	0 %	525706522
21	NC_021744	TGC	2	6	840	845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706522
22	NC_021744	TGA	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706522
23	NC_021744	T	6	6	863	868	0 %	100 %	0 %	0 %	525706522
24	NC_021744	A	6	6	872	877	100 %	0 %	0 %	0 %	525706522
25	NC_021744	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706522
26	NC_021744	TA	3	6	918	923	50 %	50 %	0 %	0 %	525706522
27	NC_021744	GAA	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706522
28	NC_021744	GCAGAA	2	12	1076	1087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525706522
29	NC_021744	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706522
30	NC_021744	A	7	7	1257	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	525706522
31	NC_021744	AAG	2	6	1290	1295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706522
32	NC_021744	TCG	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706522
33	NC_021744	ATT	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706522
34	NC_021744	CTG	2	6	1323	1328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706522
35	NC_021744	GTA	2	6	1361	1366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706522
36	NC_021744	GGC	2	6	1439	1444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525706522
37	NC_021744	ATGC	2	8	1463	1470	25 %	25 %	25 %	25 %	525706522
38	NC_021744	CAA	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021744	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021744	AT	3	6	1683	1688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021744	AGG	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021744	AAT	2	6	1762	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706523
43	NC_021744	A	6	6	1966	1971	100 %	0 %	0 %	0 %	525706523
44	NC_021744	AAAG	2	8	2002	2009	75 %	0 %	25 %	0 %	525706523
45	NC_021744	AAT	2	6	2068	2073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706523
46	NC_021744	TGC	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706523
47	NC_021744	TTC	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525706523
48	NC_021744	TGATT	2	10	2304	2313	20 %	60 %	20 %	0 %	525706523
49	NC_021744	ATT	2	6	2347	2352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706523
50	NC_021744	ATT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706523
51	NC_021744	ACT	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706523
52	NC_021744	GTA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706523
53	NC_021744	GAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706523
54	NC_021744	GGAA	2	8	2673	2680	50 %	0 %	50 %	0 %	525706523
55	NC_021744	TCA	3	9	2783	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706523
56	NC_021744	ATA	2	6	2804	2809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706523
57	NC_021744	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021744	T	7	7	2900	2906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021744	T	6	6	2948	2953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021744	TTTA	2	8	2975	2982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021744	TA	3	6	3052	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021744	CAT	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706524
63	NC_021744	TTG	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706524
64	NC_021744	AGA	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706524
65	NC_021744	ATT	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706524
66	NC_021744	TCA	2	6	3155	3160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706524
67	NC_021744	A	7	7	3233	3239	100 %	0 %	0 %	0 %	525706524
68	NC_021744	ATC	2	6	3252	3257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706524
69	NC_021744	CGG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525706524
70	NC_021744	GAA	2	6	3342	3347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706525
71	NC_021744	ATTT	2	8	3427	3434	25 %	75 %	0 %	0 %	525706525
72	NC_021744	T	6	6	3432	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	525706525
73	NC_021744	TGG	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706525
74	NC_021744	A	6	6	3574	3579	100 %	0 %	0 %	0 %	525706525
75	NC_021744	TATTT	2	10	3639	3648	20 %	80 %	0 %	0 %	525706525
76	NC_021744	AGA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706525
77	NC_021744	AGTA	2	8	3751	3758	50 %	25 %	25 %	0 %	525706525
78	NC_021744	AAT	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706525
79	NC_021744	TAT	2	6	3839	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706525
80	NC_021744	GTG	2	6	3950	3955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706525
81	NC_021744	ACC	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525706525
82	NC_021744	CTA	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706525
83	NC_021744	TGA	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706525
84	NC_021744	A	6	6	4028	4033	100 %	0 %	0 %	0 %	525706525
85	NC_021744	TAA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706525
86	NC_021744	TAC	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706525
87	NC_021744	GAT	2	6	4105	4110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706525
88	NC_021744	TCA	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706525
89	NC_021744	TGA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706525
90	NC_021744	GTT	3	9	4236	4244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706525
91	NC_021744	GAT	2	6	4249	4254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706525
92	NC_021744	TGA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706525
93	NC_021744	TAC	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706525
94	NC_021744	AAG	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706525
95	NC_021744	GT	3	6	4379	4384	0 %	50 %	50 %	0 %	525706525
96	NC_021744	A	6	6	4465	4470	100 %	0 %	0 %	0 %	525706526
97	NC_021744	AGG	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525706526
98	NC_021744	GGC	2	6	4519	4524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525706526
99	NC_021744	GTAT	2	8	4550	4557	25 %	50 %	25 %	0 %	525706526
100	NC_021744	CAC	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525706526
101	NC_021744	ATT	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706526
102	NC_021744	TGA	2	6	4620	4625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706526
103	NC_021744	GAT	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706526
104	NC_021744	A	7	7	4724	4730	100 %	0 %	0 %	0 %	525706526
105	NC_021744	GTC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706526
106	NC_021744	GGT	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706526
107	NC_021744	CGG	2	6	4788	4793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525706526
108	NC_021744	GGT	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706526
109	NC_021744	TGT	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706526
110	NC_021744	ATGAA	2	10	4931	4940	60 %	20 %	20 %	0 %	525706526
111	NC_021744	ACT	3	9	5017	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706526
112	NC_021744	AGAAT	2	10	5045	5054	60 %	20 %	20 %	0 %	525706526
113	NC_021744	ACTT	2	8	5088	5095	25 %	50 %	0 %	25 %	525706526
114	NC_021744	GGT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706526
115	NC_021744	TAT	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706526
116	NC_021744	TGA	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706526
117	NC_021744	CTAT	2	8	5207	5214	25 %	50 %	0 %	25 %	525706526
118	NC_021744	ACT	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706526
119	NC_021744	CAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525706526
120	NC_021744	GAT	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706526
121	NC_021744	TGT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706526
122	NC_021744	CAG	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525706526
123	NC_021744	CTT	2	6	5565	5570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525706526
124	NC_021744	GCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525706526
125	NC_021744	ATA	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706526
126	NC_021744	ATT	2	6	5745	5750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706526
127	NC_021744	GGT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706526
128	NC_021744	CCAA	2	8	5876	5883	50 %	0 %	0 %	50 %	525706526
129	NC_021744	ATT	2	6	5965	5970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706526
130	NC_021744	TGA	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706526
131	NC_021744	TGT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706526
132	NC_021744	ACT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706526
133	NC_021744	GATGCA	2	12	6292	6303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525706526
134	NC_021744	ATG	2	6	6458	6463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
135	NC_021744	TTCT	2	8	6469	6476	0 %	75 %	0 %	25 %	525706527
136	NC_021744	AAG	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525706527
137	NC_021744	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706527
138	NC_021744	TCA	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525706527
139	NC_021744	ATTT	2	8	6665	6672	25 %	75 %	0 %	0 %	525706527
140	NC_021744	CAA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525706527
141	NC_021744	ATG	2	6	6858	6863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
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143	NC_021744	TTG	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706527
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145	NC_021744	TGA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
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159	NC_021744	TGA	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
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161	NC_021744	GTT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525706527
162	NC_021744	GTG	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525706527
163	NC_021744	AAAG	2	8	8113	8120	75 %	0 %	25 %	0 %	525706527
164	NC_021744	GAT	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
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172	NC_021744	TAT	2	6	8716	8721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525706527
173	NC_021744	GAT	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706527
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178	NC_021744	A	6	6	8901	8906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021744	A	7	7	8918	8924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021744	T	6	6	8934	8939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021744	TAA	2	6	8943	8948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021744	A	7	7	8961	8967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021744	T	6	6	9000	9005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021744	AGG	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_021744	GGA	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_021744	TAA	2	6	10435	10440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_021744	GATT	2	8	10499	10506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
224	NC_021744	T	6	6	10505	10510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_021744	ATT	2	6	10511	10516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_021744	GAAA	2	8	11019	11026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021744	TGCT	2	8	11033	11040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
234	NC_021744	AGC	2	6	11067	11072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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237	NC_021744	AGA	2	6	11224	11229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_021744	AATCA	2	10	11336	11345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_021744	TGC	2	6	11412	11417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_021744	TGA	2	6	11439	11444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_021744	TTG	2	6	11615	11620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_021744	TTGA	2	8	11654	11661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021744	TCAT	2	8	11691	11698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
248	NC_021744	TTC	2	6	11706	11711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_021744	T	7	7	11722	11728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021744	AATT	2	8	11779	11786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021744	TCAT	2	8	11794	11801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
252	NC_021744	A	7	7	11847	11853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021744	GCCA	2	8	12011	12018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
254	NC_021744	AGC	2	6	12042	12047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_021744	GCAA	2	8	12098	12105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
256	NC_021744	AG	3	6	12216	12221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021744	TGA	2	6	12286	12291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_021744	ATC	2	6	12342	12347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_021744	AAG	2	6	12377	12382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021744	GCT	2	6	12385	12390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_021744	GCT	2	6	12598	12603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_021744	A	6	6	12633	12638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021744	AGT	2	6	12688	12693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021744	AAAC	2	8	12768	12775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
266	NC_021744	GCT	2	6	12840	12845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_021744	GCG	2	6	12883	12888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_021744	CGAA	2	8	12942	12949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
269	NC_021744	CT	3	6	13067	13072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
270	NC_021744	A	6	6	13097	13102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021744	TAA	2	6	13124	13129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_021744	CTT	2	6	13203	13208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_021744	TAT	2	6	13290	13295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_021744	GAT	2	6	13310	13315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021744	AGC	2	6	13355	13360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_021744	A	6	6	13416	13421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021744	TGA	2	6	13487	13492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525706531
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279	NC_021744	A	6	6	13560	13565	100 %	0 %	0 %	0 %	525706531
280	NC_021744	A	6	6	13595	13600	100 %	0 %	0 %	0 %	525706531
281	NC_021744	A	6	6	13606	13611	100 %	0 %	0 %	0 %	525706531
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285	NC_021744	T	6	6	13697	13702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021744	TGA	2	6	13714	13719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_021744	TAA	2	6	13740	13745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525706532
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442	NC_021744	AAT	2	6	19621	19626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_021744	AT	3	6	20164	20169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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